一、国家重点学科
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一级学科国家重点学科 （8个） |
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二级学科国家重点学科 （13个） |
马克思主义哲学、世界史、政治经济学、企业管理、英语语言文学、社会学、情报学、微电子学与固体电子学、材料物理与化学、环境科学、气象学、自然地理学、外科学（普外） |
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国家重点（培育）学科 |
注：13个二级学科国家重点学科中不包含8个一级学科国家重点学科中的24个二级学科国家重点学科 。
二、优秀师资队伍
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中国科学院、中国工程院院士 |
33人 |
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973计划和重大科学研究计划项目首席科学家 |
9人 |
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教育部“长江学者奖励计划”特聘教授、讲座教授 |
59人 |
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国家级有突出贡献的中青年科学、技术、管理专家 |
17人 |
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国家杰出青年基金获得者 |
76人 |
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教育部“新世纪优秀人才支持计划” |
96人 |
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国家级教学名师 |
7人 |
三、重点实验室
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实验室名称 |
依托单位 |
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国家实验室（1个） | |
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南京微结构国家实验室（筹） |
物理学系 电子科学与工程系 |
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国家重点实验室（6个） | |
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固体微结构物理国家重点实验室 |
物理学系 |
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现代配位化学国家重点实验室 |
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计算机软件新技术国家重点实验室 |
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内生金属矿床成矿机制研究国家重点实验室 |
地球科学与工程学院 |
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医药生物技术国家重点实验室 |
生命科学学院 |
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污染控制与资源化研究国家重点实验室（与同济大学合建） |
环境科学学院 |
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教育部重点实验室（8个） | |
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海岸与海岛开发教育部重点实验室 |
地理与海洋科学学院 |
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中尺度灾害性天气教育部重点实验室 |
大气科学学院 |
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生命分析化学教育部重点实验室 |
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高性能高分子材料实验室 |
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电子科学与工程系 | |
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现代天文与天体物理教育部重点实验室（筹） |
天文学系 |
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模式动物与疾病研究教育部重点实验室（筹） |
模式动物研究所 |
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教育部工程中心（2个） | |
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蛋白质与多肽新药教育部工程中心 |
分子医学研究所 |
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水处理与水环境修复教育部工程中心 |
环境科学学院 |
四、人才培养基地
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基地名称 |
所在院系 |
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国家基础科学、应用科学研究和教学人才培养基地 | |
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数学 |
数学系 |
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物理学 |
物理学系 |
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天文学 |
天文学系 |
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地球科学与工程学院 | |
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地理学 |
地理与海洋科学学院 |
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生物学 |
生命科学学院 |
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大理科班（多学科综合点） |
匡亚明学院 |
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生命科学学院 | |
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大气科学学院 | |
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国家基础学科人才培养和科学研究基地 | |
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中国语言文学 |
文学院 |
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历史学系 | |
五、六大“学科特区”
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特区名称 |
建立时间 |
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分子医学研究所 |
2000年5月 |
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国际地球系统科学研究所 |
2000年11月 |
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理论与计算化学研究所 |
2001年6月 |
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现代数学研究所 |
2003年10月 |
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模式动物研究所 |
2001年12月 |
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人文社会科学高级研究院 |
2005年5月 |
注：南京大学是全国率先设立学科特区的高校。学科新是学科特区“特”的关键，所涉及的学科均代表了该领域国际上最新的研究方向；机制活是“特”的核心内涵。学科特区按照国际惯例，采用所长负责制，享有充分自主权。所长看准研究方向按需招人，并实施目标考核管理。如著名数学家、美国麻省理工学院数学系首席教授、美国普林斯顿大学教授、中科院院士田刚担当所长。
六、突出成就
◇ 在最能反映基础研究水平的SCI论文排行榜上曾经在我国大学中领跑7年；近年在国际顶尖杂志Science和Nature发表的论文数全国第一。
◇ 历时19年，2006年闵乃本院士团队获得的国家自然科学一等奖，使我校成为自1999年国家奖励制度改革以来内地唯一独立获此殊荣的高校。
◇ 历时20年，2006年9月《中国思想家评传丛书》（200部）整体出版，连续荣获“首届中国政府出版奖”（我国图书出版最高奖，同时获此殊荣的还有《册府元龟》）和“首届中国文化产业创新奖”。国务委员陈至立曾赞誉它是中国传统文化研究中一项重大原创性、基础性工程。
◇ 胡福明老师于1978年撰写的《实践是检验真理的唯一标准》一文直接成为改革开发的理论先声。